卫生防护中心于2004年6月成立，旨在提升香港公共卫生系统，以应付公共卫生的挑战。透过建立疾病监测网络、加强感染控制、提升化验诊断能力、进行风险通报及健康促进活动、发展应用研究及培训计划，以及拟定紧急应变计划。